GIMPの「レイヤー」メニュー内の「透明部分」のサブメニューに、「色を透明度に」はある。

「レイヤー⇒透明部分⇒色を透明度に」をクリックすると、「色を透明度に」ダイアログなどが現れ、透過する色を指定できる。

「色」メニュー内の「色を透明度に」から、「色を透明度に」ダイアログを呼び出すこともできる。